Meripuolustuspiiri muodostaa yhden koulutus- ja tukiyksikön (KOTU). Koulutus- ja tukiyksikkö (KOTU) on Meripuolustuspiirin toiminnallinen alueellinen yksikkö. KOTU-Yksiköt  järjestävät ja organisoivat koulutusta sekä muuta maanpuolustustoimintaa. Piiri jakaantuu maantieteellisesti kahteen osaan: Suomenlahden ja Saaristomeren-Pohjanlahden koulutusalueeseen.