Yhteishengen ja yhteistyön lujittamisessa yhteisillä tunnuksilla on suuri merkitys. Sininen Reservi ry:n lipun on suunnitellut komentajakapteeni evp, heraldikko Tapani Talari. Kaikkiaan lippuja on neljä, jokaisen yläkulmassa oleva alue/maakuntatunnus on erilainen sen mukaan, käytetäänkö lippua Turun, Kotkan, Helsinki/Uusimaan vai Pohjanlahden alueella.
 
Ensimmäisenä käyttöön vihittiin Turun alueen lippu maanantaina 8.7.2002 Saaristomeren Meripuolustusalueen Meriupseerikerholla, Pansiossa. Tämä lippu oli käytössä 9.7.2002 Merivoimien vuosipäivän juhlallisuuksissa Turussa. Kotkan, Helsinki/Uusimaan ja Pohjanlahden liput vihittiin käyttöön vuonna 2002.

Lippuselitys
Sinisessä vaakasuuntaan suorakaiteisessa lippuvaatteessa Sinisen Reservin tunnus; Ankkuri jonka yläosa muodostaa atraimen, päällikkeenään kaksi tykinputkea ristissä, kaikki keltaista. Lipun koko on 140 x 120 cm. 
 

(c) Sininen Reservi ry 2008